Зовні кипарис являє собою багаторічне дерево заввишки 18-25 м або чагарник (1,5-2 м у висоту). Форма його крони дуже різноманітна. Кипарис найшвидше росте в перші роки, а потім додає всього кілька сантиментів. Тривалість його життя дуже велика. Зустрічаються екземпляри віком понад 2000 років. Стовбури бувають прямими або викривленими. Вони вкриті тонкою гладкою корою. На молодих відростках вона світло-коричнева, але з роками набуває сіро-коричневого відтінку та борозенчастої фактури.
Петяги з округлим або чотирикутним перетином вкриті дрібним листям. У ранньому віці вони відстають, а потім щільно притиснуті до пагонів. Поступово шилоподібні листочки стають лускатими. На зовнішній поверхні цілком чітко можна розгледіти жолобок (олійну залозу). Іноді вона відрізняється не тільки рельєфом, а й контрастною окантовкою. Довжина синьо-зеленої пластинки становить 2 мм.
Кипарис належить до однодомних голонасінних рослин. Чоловічі та жіночі шишки (стробіли) зустрічаються на кожній особині. Чоловічі органи (мікростробіли) виглядають, як невеликий стрижень зі спороносним листом (спорофілом). Недалеко розташовується жіночий генеративний орган - мегастробіл
